Eventos pasados

Python para bioinformática
 
Fecha: 12, 13 y 14 de marzo, 2018
Lugar: Sala informatizada, Medicina, UCR
Hora: 8:00 - 16:30 
Impartido por personal del CNCA
Formulario de aplicación:  https://goo.gl/forms/wTblzneMepjwwPZ73 

Análisis de genomas de patógenos virales a través de secuenciación de próxima generación (NGS)
 
Fecha: 31 de enero, 2018
Lugar: CIBCM, Ciudad de la Investigación, UCR
Hora: 11 am 
Expositor: Lizbeth Ramírez (INISA y SENASA) 


​TALLER DE SECUENCIACIÓN Y ANÁLISIS DE DATOS DE MICROBIOMAS USANDO EL EQUIPO MISEQ DE ILLUMINA
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Fecha:  8 al 12 de enero, 2018
Lugar: CIBCM y Laboratorio de Cómputo de la Facultad de Microbiología.
Hora: 8am - 5pm dependiendo del día. Ver cronograma adjunto.
Resumen: Para dicho taller estaremos generando librerías del gen 16S (región V3-V4) con la metodología 16S Metagenomics de Illumina y secuenciándolas en el equipo MiSeq del CIBCM. Posteriormente, en el taller de Análisis de Datos se usará la plataforma Galaxy y el command line para hacer la clasificación taxonómica de un ejemplo de comunidad microbiana.  
Inscripción: hasta el 8 de diciembre en el siguiente link
Cupo: 10 personas para el Taller de Secuenciación, 24 personas para el Taller de Análisis de Datos.
Instructores: Sarah Craig - Penn State University, Daniel Blankenberg - Cleveland Clinic Lerner Research Institute.
Consultas al correo electrónico: redbioaplicada@gmail.com

taller_16s_cronograma.pdf
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taller_microbiomas.pdf
File Size: 289 kb
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CHARLAS APLICACIONES DE LA BIOINFORMÁTICA:
     
      Infant weight gain trajectories linked to the oral microbiome composition - Dra. Kateryna Makova, Penn State
       Experimental evolution in E. coli at very short time scale​ - Dr. Anton Nekrutenko, Penn State

Fecha:  5 de enero, 2018
Lugar: La Gran Casa Universitaria, frente a la Escuela de Medicina UCR.
Hora: 4 - 6pm.
Inscripción: hasta el 15 de diciembre en el siguiente link
Cupo: 20 personas.
Consultas al correo electrónico: redbioaplicada@gmail.com


CAPACITACIÓN EN EL PAQUETE GGPLOT 
Fecha:  21,22 y 28 setiembre, 2017
Lugar: Aula de Computación, Facultad de Microbiología
Hora: 6-8:30 pm 
Resumen: El paquete ggplot es uno de los más populares en los últimos años para crear gráficos complejos que facilita la visualización de resultados. En esta capacitación se verán los siguientes temas: 1) Cómo realizar gráficos descriptivos, predictivos (ej. modelo lineal) y multivariados (NMDS),  2) Cómo modificar la estética de un gráfico, 3) Comprender cuál es la lógica que utiliza ggplot para realizar los gráficos, 4) Cómo exportar correctamente los gráficos para publicaciones científicas
Inscripción para miembros de la RedBioAplicada: del 1 al 15 de setiembre
Cupo máximo 24 personas.
Instructor: Randall Jiménez (Universidad de Ulm, estudiante de doctorado)
Requisito: participar de la Capacitación básica en el lenguaje R o demostrar conocimiento básico del lenguaje

Entendiendo las razones de la disbiosis del microbioma y su relevancia en la conservación de Lithobates vibicarius: especie modelo para la protección de la salud de anfibios amenazados 
 
Fecha: 27 setiembre, 2017
Lugar: Miniauditorio del CINA, Ciudad de la Investigación, UCR (entrar por el pasillo lateral). 
Hora: 11 am 
Expositor: Randall Jiménez (Universidad de Ulm, estudiante de doctorado)


CAPACITACIÓN BÁSICA EN EL LENGUAJE R 
Fecha: Viernes 18 y 25 de Agosto, 2017
Lugar:  Aula de Computación Facultad de Microbiología, Universidad de Costa Rica 
Hora: 6-8:30 pm
Resumen: El lenguaje y ambiente R es básico para analizar datos y graficar resultados. En esta capacitación se enseñarán los principios básicos desde la sintaxis del lenguaje, vectores, matrices, factores, data frames, y listas, así como la instalación de paquetes todo desde la aplicación RStudio.
Inscripción para miembros de la RedBioAplicada: del 9 al 16 de agosto 
Para hacer una selección de los participantes por favor indicar en el correo de qué forma va a utilizar este conocimiento en el corto o mediano plazo, si tiene conocimiento previo del lenguaje, cuáles son sus expectativas de la capacitación y si planea participar en la capacitación del paquete ggplot en setiembre 2017.
Cupo máximo 24 personas.
Instructores: Rebeca Campos (profesora UCR), Andrés Flores (estudiante de estadística, UCR)